Table S3 A   Protein profile  Thioredoxin reductase  Selenoprotein O  Deiodinase iodothyronine  15 kDa selenoprotein  Selenoprotein J  Glutathione peroxidase  EhSEP2  FrnE  Selenoprotein R  Peptide methionine sulfoxide reductase  Selenoprotein I  Ostsp2  SelK  Ostsp1  Selenoprotein H  Selenoprotein P  Sel4  SelTryp   

HMMer  E‐value  3.40E‐253  5.60E‐221  3.00E‐17  2.10E‐07  2.90E‐66  3.40E‐63  3.90E‐63  6.00E‐60  2.70E‐56  1.90E‐55  8.30E‐50  2.60E‐34  1.30E‐13  1.50E‐09  2.30E‐06  5.40E‐06  1.70E‐03  4.70E‐03 

HMMer  Match  g7770  g11791  g10588  g7985  g8841  g9125  g295  g7250  g8784  g13684  g1732  g943  g5423  g2445  g13126  g9757  g8666  g7299 

SECIS element  (SECISearch)  Yes  Yes  Yes  Yes  No  No  No  No  No  No  No  No  No  No  No  No  No  No 

STOP  codon  UGA  UGA  UGA  UGA  UGA  UAA  UAA  UAG  UAG  UGA  UAG  UAA  UAG  UAG  UAG  UGA  UGA  UGA 

HMMer  E‐value  5.80E‐17  3.30E‐13  1.90E‐11  2.40E‐08  1.80E‐07  6.70E‐07  7.30E‐06  9.60E‐05  3.00E‐04  1.40E‐03  2.20E‐03  2.50E‐03  8.00E‐03 

HMMer  Match  R362     R362     R195     L543     R656     R548     R656     R443     R362     R362     R901     L223     L115    

SECIS element  (SECISearch)  No  No  No  No  No  No  No  No  No  No  No  No  No 

STOP  codon  UAA  UAA  UAA  UGA  UAG  UAA  UAG  UAA  UAA  UAA  UAA  UAA  UAG 

B   Protein profile  Thioredoxin  EhSEP2  Glutaredoxin  Selenoprotein J  Hdra  Prx_3  Methyl‐viologen‐reducing hydrogenase  Thiol:disulfide interchange protein  Peroxiredoxin  DSBA oxidoreductase  Methionine sulfoxide reductase A  Selenoprotein R  Ferredoxin‐thioredoxin reductase